กองอำนวยการสำนักงานอธิการบดี
กองอำนวยการ แต่เดิมเป็นฝ่ายธุรการสังกัดสำนักงานอธิการบดี มหาวิทยาลัยอิสลามยะลา ต่อมาเมื่อมีการปรับปรุงโครงสร้างการบริหารตามประกาศมหาวิทยาลัย เรื่องประกาศใช้โครงสร้างการบริหารมหาวิทยาลัยอิสลามยะลา ฉบับปรับปรุง พ.ศ.2546 (ค.ศ. 2003) ประกาศ ณ วันที่ 20 พฤษภาคม 2546 ฝ่ายธุรการสำนักงานอธิการบดีได้รับการยกระดับเป็นหน่วยงานระดับกอง ต่อมามหาวิทยาลัยได้เปลี่ยนชื่อมาเป็นมหาวิทยาลัยฟาฏอนี ประกาศ ณ วันที่ 31 ตุลาคม พ.ศ. 2556 กองอำนวยการยังคงอยู่ภายใต้สังกัดสำนักงานอธิการบดี มีนายอัดนัน แวสาหะ เป็นหัวหน้ากอง โดยรับผิดชอบงานดังนี้
1.งานสารบรรณ
2.งานประชุม
3.งานประสาน และ
4.งานไปรษณีย์
ปรัชญา ปณิธาน และพันธกิจ
“คุณภาพมิได้เป็นเพียงส่วนที่อยู่ในกระบวนการทำงานตั้งแต่ต้นจนกระทั่งจบเท่านั้น หากแต่คุณภาพยังเป็นส่วนหนึ่งของความรู้สึกนึกคิด และจิตวิญญาณ”
มุ่งพัฒนา ระบบงานและบุคลากร
มุ่งสนอง ความพึงพอใจของผู้ใช้บริการที่หลากหลาย
มุ่งนำ นวัตกรรมและเทคโนโลยีมาปรับใช้ในการปฏิบัติงาน
มุ่งเน้น การประสาน สนับสนุนและร่วมมือ
มุ่งยกระดับ สู่หน่วยงานคุณภาพ
1-ปรับปรุงสำนักงานให้เป็นระเบียบเรียบร้อยและมีความทันสมัย
2-ปรับปรุงระบบการให้บริการที่มีความสะดวกและรวดเร็ว
3-เพิ่มประสิทธิภาพการบริหารจัดการ
4-พัฒนาบุคลากรให้มีศักยภาพในการให้บริการ
5-สร้างสัมพันธ์แห่งความเป็นพี่น้อง
กองอำนวยการเป็นหน่วยงานที่มีประสิทธิภาพและการให้บริการที่ได้มาตรฐาน
